如何视频:划痕检测应用程序

本操作视频提供了设置和运行BioTek的划痕检测应用程序的快速概述。该应用程序旨在分析使用BioTek的Autoscratch创面制造工具加工过的钢板，以监测细胞随时间的迁移，并生成描述伤口愈合过程的定量数据。

脚本:

大家好，欢迎来到BioTek划痕检测App．这个应用程序是用来分析使用BioTek的自动刮伤制作工具加工过的板。它允许您自动收集多个数据点，随着时间的推移监测细胞迁移，并生成定量数据来描述伤口愈合过程。

打开划痕检测App，一个新的空白划痕检测模板生成。要导航到以前生成的数据或导入以前的设置，请单击左上角的菜单图标。

要设置一个新的实验，让我们使用左边的菜单逐步完成工作流程。在这里，您将指定培养温度，37度或室温，总持续时间可达72小时，您的测量间隔，以及您使用的康宁板类型，96孔或24孔。在平板设置下，我们将选择感兴趣的成像区域，你可以成像整个平板或只是几列，这取决于你，你也可以分配井信息，以区分对照井和任何药物处理井。

现在我们继续设置自动曝光。选择一到四个有代表性的孔，单击“开始自动曝光”。在给你的文件命名后，你会被提示把你的盘子放在载体上。在继续进行实验之前，自动曝光过程作为视觉检查来监视细胞健康和划痕质量。如果一切正常，单击start run。

现在我们的伤口愈合实验已经完成，让我们开始分析。单击“添加”，选择有代表性的井，确定合适的设置。我建议选择伤口愈合开始之前的早期时间点，以及伤口接近愈合的较晚时间点。这将确保设置适用于所有时间点和治疗。用遮罩将细胞与背景区分开。通过调整阈值来控制掩码的严格程度。虽然默认设置通常是合适的，但您可能需要进行微调和优化。例如，阈值过低将无法排除您的背景。而过高的阈值将开始排除一些较暗的细胞区域。

您可以调整最小对象大小，以帮助消除任何被错误识别的小碎片，或处理在单元格层中看到的任何碎片。让我们看看另一口井，使设置是最佳的。这些结果看起来不错。您可以应用亮度和对比度调整，虽然这不会对分析产生任何影响，但可以增强图像和电影的外观。还要注意，当前的掩码视图将包含在最终的图像中。选择显示ON、OFF或您喜欢的填充，然后选择Apply to all well，将您的分析设置应用于所有井和所有时间点。这可能需要一些时间，具体取决于图像的总数。

一旦分析完成，就会自动生成图表来显示平均伤口宽度或伤口汇合度随时间的变化。它还将计算伤口迁移的最大速率。您可以导出您的个人图像或电影。选择你想要输出的井和时间点。现在您可以选择导出图像，以便为每个井生成单独的图像文件，或为电影调整帧率和格式，然后选择导出电影。您还可以导出缠绕宽度和汇流曲线。它们可以单独导出，也可以组合并叠加在单个图形上。单独的图形可以在导出曲线下面导出，而组合曲线可以在这里配置。选择你想要合并的井和预览点击显示。然后可以导出生成的图。

所有的原始数据和井位分配也都是可用的。并通过选择导出数据导出到电子表格。

这个应用程序提供了一个简单而直接的方法来收集和可视化你的伤口愈合实验数据。如果您有任何问题或支持需求，请联系我们技术援助中心．