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活体SARS-CoV-2研究:相互关联的部分共同工作
波士顿大学，国家新兴传染病实验室(NEIDL)
9-June-20
2008年，当罗伯特·戴维(Robert Davey)博士在加尔维斯顿的德克萨斯大学医学分部(UTMB)开始研究埃博拉病毒药物开发时，他并不知道自己的工作能让他在一种截然不同的全球流行病的治疗方法的研究中发挥多么重要的作用。事实上，许多细节都支持他目前在筛选小分子化合物方面的作用，这些化合物可能用于对抗SARS-CoV-2，即导致COVID-19的新型冠状病毒。
这个过程符合
当Davey博士从UTMB转移到位于圣安东尼奥的德克萨斯州生物医学研究所时，他开发了一个在生物安全四级(BSL-4)最大密封实验室中有效筛选小分子药物化合物的管道。
考虑到BSL-4实验室严格的安全和安全措施，实验室配备了小型自动化产品，包括来自BioTek Instruments的许多产品，可以提高吞吐量，同时减少人工交互，减少用户安全风险，提高准确性。乐鱼平台入口如果这些工具发生了什么事，它们可以被净化，并很容易地从实验室移走，不像大型机器人系统需要高度专业技术人员的服务。
2018年，Davey博士在波士顿大学(BU)国家新兴传染病实验室(NEIDL)建立了一个新实验室。随着2019年底SARS-CoV-2疫情的传播，他意识到他在高度控制下的药物筛选过程将对新型冠状病毒非常有效，并迅速将研究努力转向这一目标。
2020年3月20日，在国家新兴传染病实验室(NEIDL)，戴维实验室的成员包括博士生Callie Donahue(左起)、DVM博士Hiroyuki More、博士Robert Davey和博士Manu Anantpadma。该团队的目标是开发一种小分子药物治疗来阻止SARS-CoV-2的感染。
由波士顿大学摄影Cydney Scott拍摄
欢迎来到BioTek宇宙
他说:“我们需要灵活性和模块化、联锁交互，而不需要重新编程，这就是为什么我们在波士顿大学的实验室里创建了‘BioTek Universe’。”这个所谓的宇宙由两个组成世界杯2022赛程时间表
细胞成像多模式阅读器，二BioStack™微孔板堆垛机，和两个MultiFlo™外汇多模式分发器，预计很快将扩展到包括第三个生物堆栈和一个LS 405™洗板机。
每天晚上，将含有经药物化合物SARS-CoV-2处理并用荧光标记抗体或寡核苷酸染色的384孔微孔板装载到BioStacks上。一夜之间，BioStacks将底片送入Cytations进行高含量成像。Davey博士认为Cytations方法在空间有限的实验室中占地面积小，具有自动对焦功能，并可通过堆叠器读取条形码，可与软件很好地集成以跟踪样品并加强质量控制。
Davey博士还使用了Cytation公司的16位摄像头，他指出:“一个敏感的16位摄像头可以提供65000个灰度，对我来说，这意味着在检测中有更多的信号宽度，而更常见的12位摄像头只有4000个灰度。”
由波士顿大学摄影Cydney Scott拍摄
创建坚实的基础
在这项冠状病毒研究项目开始时，戴维博士获得了与SARS-CoV-2发生交叉反应的SARS-CoV-1病毒抗体。细胞培养很快识别出反应差的抗体，然后被排斥。此外，利用Cytation将宿主细胞的范围缩小到那些强壮的和易于高通量的细胞。他说:“一致性对我们的流程绝对是至关重要的。”“通过让它每次都以同样的方式工作，消除潜在的细微差别，我们可以自信地说，当雷达上出现一个光点时，它真的很重要。”
把它们放在一起
戴维博士的实验室迄今为止完成的最大屏幕包括2.8万个数据点，“BioTek Universe”在提供灵活性的同时继续可靠地运行。Davey博士喜欢知道他们可以在不中断工作流程或交流的情况下移动不同的BioTek元素。
他指出，虽然BioTek的Gen5™软件非常好，但他们使用了不同的软件平台进行分析。“其他平台采用专有图像格式，对我来说，这是没有意义的;这是限制性的，”他评论道。“BioTek使用开放的图像格式，这样我们就可以导出图像。这给了我从图像中获取尽可能多信息的灵活性。”
使用Cytation - 1拍摄的SARS-CoV-2药物筛选图像。384孔板在存在候选小分子治疗的情况下被病毒攻击。36小时后，用福尔马林固定细胞，然后用抗n抗体染色，Alexa 448标记的二抗检测感染细胞(绿色)。胞核用Hoechst 33342染色(蓝色)。对整个平板成像后，使用高内容图像分析软件对图像进行处理，计算细胞核和感染细胞数量。图片显示(A)正常的感染有许多感染细胞，(B)处理细胞的感染效率降低。
要了解更多关于波士顿大学(BU)、国家新兴传染病实验室(NEIDL)的信息，请访问他们的网站．
感谢国家新兴传染病实验室(NEIDL)的Robert Davey博士分享他在BioTek的经验。